问题 创建参数R降价文档?
我想迭代我的R markdown文件中的结果集列表。当我生成输出时,我想要包含一些文本,例如带有结果集名称的标题。
我发现一个hacky解决方案是直接在这样的文档中硬编码html输出
## All results
```{r loopResults, echo=FALSE, results='asis'}
results = list(result1 = data.frame(x=rnorm(3), y=rnorm(3)), result2=data.frame(x=rnorm(3), y=rnorm(3)))
for(res in names(results)) {
cat(paste("<h3>Results for: ", res, "</h3>>"))
plot(results[[res]]$x, results[[res]]$y)
}
这似乎不是正确的做事方式,特别是因为我想在时间通过pandoc创建PDF文档,并且必须更改硬编码表达式。 (我目前有便利功能,如h3(文本,类型))。
有更好的方法吗?
7532
2018-02-19 13:58
起源
答案:
我会结合使用 brew
和 knitr
为了达成这个。我会创建一个名为的brew模板 doc.brew
看起来像这样
<% for (res in names(results)) { -%>
### Results for: <%= res %>
```{r}
plot(results[["<%= res %>"]]$x, results[["<%= res %>"]]$y)
```
<% } %>
您现在可以运行以下代码来获得所需的输出
results = list(
result1 = data.frame(x=rnorm(3), y=rnorm(3)),
result2=data.frame(x=rnorm(3), y=rnorm(3))
)
brew::brew('doc.brew', 'doc.Rmd')
knit2html('doc.Rmd')
7
2018-02-19 21:51
一种可能性是使您的降价文件生成降价而不是HTML。例如 :
## All results
```{r loopResults, echo=FALSE, results='asis'}
results = list(result1 = data.frame(x=rnorm(3), y=rnorm(3)), result2=data.frame(x=rnorm(3), y=rnorm(3)))
for(res in names(results)) {
cat(paste("Results for: ", res,"\n"))
cat("=========================\n")
plot(results[[res]]$x, results[[res]]$y)
cat("\n")
}
```
如果你申请 knit()
在R中运行它,您将获得以下Markdown文件:
## All results
Results for: result1
=========================

Results for: result2
=========================

你应该可以使用 pandoc
从这个文件生成HTML或LaTeX?
4
2018-02-19 14:06
以下 https://gist.github.com/yihui/3145751 你可以编写一个包含的子模板并循环它。
foosub.Rmd
Results for `r res`
---------------------------
```{r}
plot(results[[res]]$x, results[[res]]$y)
```
foo.Rmd
```{r loopResults, include=FALSE}
results = list(result1 = data.frame(x=rnorm(3), y=rnorm(3)), result2=data.frame(x=rnorm(3), y=rnorm(3)))
out=NULL
for(i in 1:length(results)) {
res = names(results)[i]
out = c(out, knit_child('foosub.Rmd', sprintf('foosub-%d.txt', i)))
}
```
`r paste(out, collapse = '\n')`
主文件中的代码块本身不会产生任何输出,它只是呈现子文档,每个结果一个,并将其全部存储在 out
(这就是它的原因 include=FALSE
)。所有格式化的输出都收集在 out
变量并由最后一行插入。
它有点尴尬,但它确实鼓励模块化,但它似乎并不像能够做到这么简单:
```{r}
for(i in 1:10){
```
Plot `r i`
-----------
```{r}
plot(1:i)
}
```
你不能。
4
2018-02-19 14:21
另一种解决方案 拉皮条:
<% for (res in names(results)) { %>
### Results for: <%= res %>
<%=
plot(results[[res]]$x, results[[res]]$y)
%>
<% } %>
只是 Pandoc.brew
这一次是为了得到你想要的:
> Pandoc.brew('doc.brew')
### Results for: result1

### Results for: result2

或者生成HTML / docx / etc.在一次运行:
> Pandoc.brew('doc.brew', output = tempfile(), convert = 'html')
> Pandoc.brew('doc.brew', output = tempfile(), convert = 'docx')
0
2018-03-09 10:49